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cuffdiff
概要
Cufflinksのコマンドの1つです。
異なる2群間の発現量やスプライスパターンの差異を検出します。
入力ファイル
2群間のマップ済みのリード(bam)
Cuffmergeでマージされたトランスクリプト(gtf)
出力ファイル
発現量の統計情報(tsv)