cuffdiff

概要

Cufflinksのコマンドの1つです。
異なる2群間の発現量やスプライスパターンの差異を検出します。

入力ファイル

  • 2群間のマップ済みのリード(bam)
  • Cuffmergeでマージされたトランスクリプト(gtf)

出力ファイル

  • 発現量の統計情報(tsv)