cuffdiff

概要

Cufflinksのコマンドの1つです。
異なる2群間の発現量やスプライスパターンの差異を検出します。

入力ファイル

  • 2群間のマップ済みのリード（bam）
  • Cuffmergeでマージされたトランスクリプト（gtf）

出力ファイル

  • 発現量の統計情報（tsv）