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tophat2
概要
スプライスジャンクションを考慮したマッピングを行います。
入力ファイル
シングルエンドの場合:
FASTQ File
ペアエンドの場合:
FASTQ File(フォワード側)
FASTQ File(リバース側)
出力ファイル
マッピング情報(txt, bed)
マップ済みリード(bam)